|
|
Koherencí řízený holografický mikroskop ve výzkumu životního cyklu buňky
Bartoníček, Jan ; Chmelík, Radim (oponent) ; Uhlířová, Hana (vedoucí práce)
Předmětem bakalářské práce je pozorování živých buněk v transmisním holografickém mikroskopu vyvinutém na ÚFI VUT a porovnání této zobrazovací metody s mikroskopem s fázovým kontrastem. Úvodní část je věnována základnímu popisu použitých zobrazovacích technik a biologii buňky. Následuje popis přípravy experimentů. V části věnující se analýze dat je popsána metoda dynamických fázových diferencí a navržena metoda sledování růstu. Obě metody byly použity pro analýzu experimentů popsaných v poslední části práce. Experimenty byly zaměřeny na získání časosběrných dat zachycujících buněčný cyklus a zejména mitosu.
|
|
|
Metabolismus mitotického inhibitoru BTB-1 enzymy první fáze biotransformace
Vančurová, Kateřina ; Indra, Radek (vedoucí práce) ; Martináková, Lenka (oponent)
Onemocnění rakovinou je stále jedno z nejčastějších úmrtí na světě, proto je třeba vyvíjet nová léčiva a tím zastavit či zpomalit tuto nemoc. V poslední době dochází k obrovskému rozmachu ve vývoji léčiv. Mezi cytostatika, která jsou stále hojně využívaná, patří také skupina mitotických inhibitorů, jejichž cílem je inhibovat mitózu. Zástupcem mitotického inhibitoru je malá nově objevená molekula BTB-1. Tato molekula zprostředkovává reverzibilní inhibici molekulárního motoru Kif18A, který hraje důležitou roli při buněčném dělení. V první části předkládané bakalářské práce byla vytvářena vhodná metoda pro stanovení BTB-1 pomocí vysokoúčinné kapalinové chromatografie a následně byla ověřována její citlivost. Dále bylo hledáno vhodné extrakční činidlo. Ve druhé části bakalářské práce byl studován metabolismus BTB-1 za použití mikrosomálního systému nepremedikovaných (kontrolních) potkanů a potkanů premedikovaných různými induktory cytochromu P450. Následně byla studována časová závislost přeměny BTB-1 pomocí mikrosomálního systému premedikovaných potkanů. Rovněž byl studován vliv různých koncentrací BTB-1 na jeho metabolismus za použití mikrosomálního systému premedikovaných potkanů. Dále byl metabolismus této nové molekuly studován za použití cytosolárních systémů vyizolovaných z jater, plic a ledvin...
|
|
|
Role of RecQ helicases in maintenance of genomic stability during mitosis
Černoch, Marek ; Janščák, Pavel (vedoucí práce) ; Půta, František (oponent)
Helikázy jsou proteiny schopné rozplétání nukleových kyselin, jejich dysfunkce může být nebezpečná pro genomovou stabilitu buňky. Pět helikáz rodiny RecQ identifikovaných v lidských buňkách se podílí na mnoha buněčných pochodech během celého buněčného cyklu včetně mitózy a jsou proto důležité pro jejich správnou funkci. Mutace v helikázách RecQ může způsobit jejich dysfunkci a vážně narušit různé buněčné procesy, například replikaci DNA, kontrolu poškození DNA nebo rozdělení sesterských chromatid. Mutace mohou také vést k nebezpečným syndromům, jejichž typickým příznakem je zvýšené riziko vzniku rakoviny.
|
|
|
Investigating the role of zinc transporter ZIP 6 and STAT3 in mitosis
Burgetová, Lenka ; Čečková, Martina (vedoucí práce) ; Štaud, František (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Studentka: Lenka Burgetová Školitel: PharmDr. Martina Čečková PhD. Školitel specialista: Dr. Kathryn Taylor PhD. Název diplomové práce: Studium role zinkového transportéru ZIP 6 a STAT3 v mitóze Bylo prokázáno, že STAT3 (přenašeč signálu a aktivátor transkripce 3) se podílí na vzniku rakoviny. ZIP6 je cílem tohoto transkripčního faktoru. Větší část dosavadního výzkumu byla zaměřena jen na aktivaci STAT3 po fosforylaci tyrosinu, zatímco fosforylace serinu zůstala relativně neprozkoumána. Domníváme se, že fosforylace serinu je aktivována v průběhu mitózy tamoxifen-rezistentních prsních nádorových buněk (TamR), a že zinkový transportér ZIP6 a na serinu fosforylovaný STAT3 jsou zahrnuty v zinkem zprostředkovaném mechanismu mitózy. Při použití nocodazolu pro navození zástavy mitózy, jsme pozorovali snížení exprese na tyrosinu fosforylovaného STAT3, zatímco exprese STAT3 fosforylovaného na serinu byla u mitotických buněk zvýšena. Přidání zinku mělo za následek vyrušení účinku nocodazolu, obnovení buněčného cyklu a proteolytické štěpení STAT3, což svědčí pro nový mechanizmus úniku z mitózy. Dále jsme objevili, že ZIP6 je v průběhu mitózy štěpen na N-terminálním úseku a přemístěn z endoplazmatického...
|
|
|
Regulace mTOR dráhy v meióze oocytu
Schmidtová, Barbara ; Šušor, Andrej (vedoucí práce) ; Krylov, Vladimír (oponent)
Savčí cíl rapamycinu (mTOR) je serin-threoninová kináza, která se v posledním desetiletí stala významným tématem mnohých studií, které vedou k novým poznatkům o tom, jak buňka funguje. Podílí se na proteosyntéze, metabolismu, regulaci buněčného cyklu, proliferaci a odpovědi na přítomnost živin a růstových faktorů. Jsou popsána určitá onemocnění, která jsou způsobena mutacemi v mTOR genu, což vede k abnormální funkci této kinázy. Mezi tyto onemocnění patří rakovina či porucha plodnosti. Výzkum zaměřený na mTOR je přínosný i díky tomu, že se hledají farmaka, která by mohla ovlivňovat jeho funkci a tím poskytnout léčbu pro tato onemocnění. Mezi nejznámější patří inhibitor Rapamycin a jeho deriváty. Cílem této bakalářské práce je shrnutí poznatků v podobě literární rešerše o tom, jak může být mTOR regulován a o roli jeho substrátů při fungování buňky. Dalším cílem je přiblížit roli mTOR při vývoji oocytu, translaci a v lidském zdraví. Klíčová slova: Oocyt, mTOR, translace, 4E-BP1, MPF, meióza, AKT
|
|
|
Storage cells and their role in tardigrade physiology.
Czerneková, Michaela ; Svoboda, Petr (vedoucí práce) ; Delagoutte, Emmanuelle (oponent) ; Weyda, František (oponent)
ZÁSOBNÍ BUŇKY A JEJICH ROLE VE FYZIOLOGII ŽELVUŠEK ABSTRAKT Želvušky (kmen Tardigrada) dokáží tolerovat řadu stresových podmínek (například téměř úplnou dehydrataci, vystavení extrémně nízkým i vysokým teplotám, a dokonce I otevřenému vesmírnému prostoru). Spadají tak mezi nejodolnější a radiaci-nejresistentnější mnohobuněčné organismy. Jejich tělní dutina je vyplněna volnými zásobními buňkami (tzv. storage cells, SC). Jejich role při anhydrobióze želvušek je předmětem diskuzí. Hlavním cílem této práce je (i) analyzovat přítomnost mitózy u SC, (ii) najít faktory, které ovlivňují anhydrobiotické přežití želvušek a (iii) popsat ultrastrukturu SC a ultrastrukturu SC vystavených stresorům desikace a teplotnímu stresu. Modelovým druhem pro všechny studie je druh R. cf. coronifer. Jedinci tohoto druhu jsou jedi z nejhojněji probádaných s ohledem na anhydrobiózu. Pro tyto účely byla využita řada histochemických technik v kombinaci se SEM, TEM a konfokální mikroskopií. Za prvé, frekvence mitotického dělení SC želvušek je častější u juvenilních jedinců než u dospělců, a koreluje s růstovou fází jedinců. Výskyt mitózy je častější u jedinců v procesu ekdyze, ale celkový mitotický index je nízký. Dále, želvušky druhu R. cf. coronifer přežijí maximum šesti po sobě následujících cyklů desikace/rehydratace. S každým...
|
|
|
Gene regulation in four dimensions
Vaňková Hausnerová, Viola ; Lanctôt, Christian (vedoucí práce) ; Převorovský, Martin (oponent) ; Krásný, Libor (oponent)
Zobrazování transkripce na úrovni jednotlivých buněk prokázalo, že se jedná o proces, který neprobíhá souvisle, ale přerušovaně. K tomuto pozorování, které bylo zaznamenáno u celé řady organizmů sahající od bakterií k savčím buňkám, se vztahuje nyní hojně využívaný termín transkripční pulzování. Dynamika transkripčního pulzování je ovlivněna jak rysy vlastními samotnému procesu transkripce, tak nadřazenými faktory jako je prostředí chromatinu, signální molekuly nebo fáze buněčného cyklu. V první části této práce jsme se zaměřili na regulaci transkripčního pulzování v jadérku. Pomocí mikroskopického sledování živých buněk jsme ukázali, že transkripce transgenu vloženého do jadérka a přepisovaného RNA polymerázou II probíhá v pulzech. Ve druhé části práce jsme se zabývali vztahem mezi dekondenzací chromatinu a dynamikou transkripce. Pomocí hyperosmotického média jsme indukovali globální kondenzaci chromatinu a objevili jsme, že během dekondenzace chromatinu dochází v jednotlivých živých buňkách k časově omezenému nárůstu intenzity transkripce. Dále jsme analyzovali expresi genů TFRC a POLR2A s použitím metody single molecule RNA FISH. Během omezeného období, které kolidovalo s dekondenzací chromatinu v telofázi/časné G1 fázi buněčného cyklu, jsme zaznamenali nárůst ve frekvenci i velikosti...
|
|
|
Investigating the role of zinc transporter ZIP 6 and STAT3 in mitosis
Burgetová, Lenka ; Čečková, Martina (vedoucí práce) ; Štaud, František (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Studentka: Lenka Burgetová Školitel: PharmDr. Martina Čečková PhD. Školitel specialista: Dr. Kathryn Taylor PhD. Název diplomové práce: Studium role zinkového transportéru ZIP 6 a STAT3 v mitóze Bylo prokázáno, že STAT3 (přenašeč signálu a aktivátor transkripce 3) se podílí na vzniku rakoviny. ZIP6 je cílem tohoto transkripčního faktoru. Větší část dosavadního výzkumu byla zaměřena jen na aktivaci STAT3 po fosforylaci tyrosinu, zatímco fosforylace serinu zůstala relativně neprozkoumána. Domníváme se, že fosforylace serinu je aktivována v průběhu mitózy tamoxifen-rezistentních prsních nádorových buněk (TamR), a že zinkový transportér ZIP6 a na serinu fosforylovaný STAT3 jsou zahrnuty v zinkem zprostředkovaném mechanismu mitózy. Při použití nocodazolu pro navození zástavy mitózy, jsme pozorovali snížení exprese na tyrosinu fosforylovaného STAT3, zatímco exprese STAT3 fosforylovaného na serinu byla u mitotických buněk zvýšena. Přidání zinku mělo za následek vyrušení účinku nocodazolu, obnovení buněčného cyklu a proteolytické štěpení STAT3, což svědčí pro nový mechanizmus úniku z mitózy. Dále jsme objevili, že ZIP6 je v průběhu mitózy štěpen na N-terminálním úseku a přemístěn z endoplazmatického...
|
|
|
Role of RecQ helicases in maintenance of genomic stability during mitosis
Černoch, Marek ; Janščák, Pavel (vedoucí práce) ; Půta, František (oponent)
Helikázy jsou proteiny schopné rozplétání nukleových kyselin, jejich dysfunkce může být nebezpečná pro genomovou stabilitu buňky. Pět helikáz rodiny RecQ identifikovaných v lidských buňkách se podílí na mnoha buněčných pochodech během celého buněčného cyklu včetně mitózy a jsou proto důležité pro jejich správnou funkci. Mutace v helikázách RecQ může způsobit jejich dysfunkci a vážně narušit různé buněčné procesy, například replikaci DNA, kontrolu poškození DNA nebo rozdělení sesterských chromatid. Mutace mohou také vést k nebezpečným syndromům, jejichž typickým příznakem je zvýšené riziko vzniku rakoviny.
|
|
|
Koherencí řízený holografický mikroskop ve výzkumu životního cyklu buňky
Bartoníček, Jan ; Chmelík, Radim (oponent) ; Uhlířová, Hana (vedoucí práce)
Předmětem bakalářské práce je pozorování živých buněk v transmisním holografickém mikroskopu vyvinutém na ÚFI VUT a porovnání této zobrazovací metody s mikroskopem s fázovým kontrastem. Úvodní část je věnována základnímu popisu použitých zobrazovacích technik a biologii buňky. Následuje popis přípravy experimentů. V části věnující se analýze dat je popsána metoda dynamických fázových diferencí a navržena metoda sledování růstu. Obě metody byly použity pro analýzu experimentů popsaných v poslední části práce. Experimenty byly zaměřeny na získání časosběrných dat zachycujících buněčný cyklus a zejména mitosu.
|
host ::
RSS.